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matrices.h File Reference


Variables

char * amino_acid_order = "ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWXYZ"
short blosum30mt []
short blosum40mt []
short blosum45mt []
short blosum62mt2 []
short blosum80mt []
short pam20mt []
short pam60mt []
short pam120mt []
short pam350mt []
short idmat []
short gon40mt []
short gon80mt []
short gon120mt []
short gon160mt []
short gon250mt []
short gon300mt []
short gon350mt []
char * nucleic_acid_order = "ABCDGHKMNRSTUVWXY"
short clustalvdnamt []
short swgapdnamt []

Variable Documentation

char* amino_acid_order = "ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWXYZ"
 

short blosum30mt[]
 

Initial value:

{
  4,
  0,  5,
 -3, -2, 17,
  0,  5, -3,  9,
  0,  0,  1,  1,  6,
 -2, -3, -3, -5, -4, 10,
  0,  0, -4, -1, -2, -3,  8,
 -2, -2, -5, -2,  0, -3, -3, 14,
  0, -2, -2, -4, -3,  0, -1, -2,  6,
  0,  0, -3,  0,  2, -1, -1, -2, -2,  4,
 -1, -1,  0, -1, -1,  2, -2, -1,  2, -2,  4,
  1, -2, -2, -3, -1, -2, -2,  2,  1,  2,  2,  6,
  0,  4, -1,  1, -1, -1,  0, -1,  0,  0, -2,  0,  8,
 -1, -2, -3, -1,  1, -4, -1,  1, -3,  1, -3, -4, -3, 11,
  1, -1, -2, -1,  2, -3, -2,  0, -2,  0, -2, -1, -1,  0,  8,
 -1, -2, -2, -1, -1, -1, -2, -1, -3,  1, -2,  0, -2, -1,  3,  8,
  1,  0, -2,  0,  0, -1,  0, -1, -1,  0, -2, -2,  0, -1, -1, -1,  4,
  1,  0, -2, -1, -2, -2, -2, -2,  0, -1,  0,  0,  1,  0,  0, -3,  2,  5,
  1, -2, -2, -2, -3,  1, -3, -3,  4, -2,  1,  0, -2, -4, -3, -1, -1,  1,  5,
 -5, -5, -2, -4, -1,  1,  1, -5, -3, -2, -2, -3, -7, -3, -1,  0, -3, -5, -3, 20,
  0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1,  0,  0,  0,  0,  0, -1,  0, -1,  0,  0,  0, -2, -1,
 -4, -3, -6, -1, -2,  3, -3,  0, -1, -1,  3, -1, -4, -2, -1,  0, -2, -1,  1,  5, -1,  9,
  0,  0,  0,  0,  5, -4, -2,  0, -3,  1, -1, -1, -1,  0,  4,  0, -1, -1, -3, -1,  0, -2,  4}

short blosum40mt[]
 

Initial value:

{
  5,
 -1,  5,
 -2, -2, 16,
 -1,  6, -2,  9,
 -1,  1, -2,  2,  7,
 -3, -3, -2, -4, -3,  9,
  1, -1, -3, -2, -3, -3,  8,
 -2,  0, -4,  0,  0, -2, -2, 13,
 -1, -3, -4, -4, -4,  1, -4, -3,  6,
 -1,  0, -3,  0,  1, -3, -2, -1, -3,  6,
 -2, -3, -2, -3, -2,  2, -4, -2,  2, -2,  6,
 -1, -3, -3, -3, -2,  0, -2,  1,  1, -1,  3,  7,
 -1,  4, -2,  2, -1, -3,  0,  1, -2,  0, -3, -2,  8,
 -2, -2, -5, -2,  0, -4, -1, -2, -2, -1, -4, -2, -2, 11,
  0,  0, -4, -1,  2, -4, -2,  0, -3,  1, -2, -1,  1, -2,  8,
 -2, -1, -3, -1, -1, -2, -3,  0, -3,  3, -2, -1,  0, -3,  2,  9,
  1,  0, -1,  0,  0, -2,  0, -1, -2,  0, -3, -2,  1, -1,  1, -1,  5,
  0,  0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1,  0, -1, -1,  0,  0, -1, -2,  2,  6,
  0, -3, -2, -3, -3,  0, -4, -4,  4, -2,  2,  1, -3, -3, -3, -2, -1,  1,  5,
 -3, -4, -6, -5, -2,  1, -2, -5, -3, -2, -1, -2, -4, -4, -1, -2, -5, -4, -3, 19,
  0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1,  0, -1, -2, -1, -1,  0,  0, -1, -2, -1,
 -2, -3, -4, -3, -2,  4, -3,  2,  0, -1,  0,  1, -2, -3, -1, -1, -2, -1, -1,  3, -1,  9,
 -1,  2, -3,  1,  5, -4, -2,  0, -4,  1, -2, -2,  0, -1,  4,  0,  0, -1, -3, -2, -1, -2,  5}

short blosum45mt[]
 

Initial value:

{
  5,
 -1,  4,
 -1, -2, 12,
 -2,  5, -3,  7,
 -1,  1, -3,  2,  6,
 -2, -3, -2, -4, -3,  8,
  0, -1, -3, -1, -2, -3,  7,
 -2,  0, -3,  0,  0, -2, -2, 10,
 -1, -3, -3, -4, -3,  0, -4, -3,  5,
 -1,  0, -3,  0,  1, -3, -2, -1, -3,  5,
 -1, -3, -2, -3, -2,  1, -3, -2,  2, -3,  5,
 -1, -2, -2, -3, -2,  0, -2,  0,  2, -1,  2,  6,
 -1,  4, -2,  2,  0, -2,  0,  1, -2,  0, -3, -2,  6,
 -1, -2, -4, -1,  0, -3, -2, -2, -2, -1, -3, -2, -2,  9,
 -1,  0, -3,  0,  2, -4, -2,  1, -2,  1, -2,  0,  0, -1,  6,
 -2, -1, -3, -1,  0, -2, -2,  0, -3,  3, -2, -1,  0, -2,  1,  7,
  1,  0, -1,  0,  0, -2,  0, -1, -2, -1, -3, -2,  1, -1,  0, -1,  4,
  0,  0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, -1, -1, -1,  0, -1, -1, -1,  2,  5,
  0, -3, -1, -3, -3,  0, -3, -3,  3, -2,  1,  1, -3, -3, -3, -2, -1,  0,  5,
 -2, -4, -5, -4, -3,  1, -2, -3, -2, -2, -2, -2, -4, -3, -2, -2, -4, -3, -3, 15,
  0, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1,  0,  0, -1, -2, -1,
 -2, -2, -3, -2, -2,  3, -3,  2,  0, -1,  0,  0, -2, -3, -1, -1, -2, -1, -1,  3, -1,  8,
 -1,  2, -3,  1,  4, -3, -2,  0, -3,  1, -2, -1,  0, -1,  4,  0,  0, -1, -3, -2, -1, -2,  4}

short blosum62mt2[]
 

Initial value:

{
  8,
 -4,  8,
  0, -6, 18,
 -4,  8, -6, 12,
 -2,  2, -8,  4, 10,
 -4, -6, -4, -6, -6, 12,
  0, -2, -6, -2, -4, -6, 12,
 -4,  0, -6, -2,  0, -2, -4, 16,
 -2, -6, -2, -6, -6,  0, -8, -6,  8,
 -2,  0, -6, -2,  2, -6, -4, -2, -6, 10,
 -2, -8, -2, -8, -6,  0, -8, -6,  4, -4,  8,
 -2, -6, -2, -6, -4,  0, -6, -4,  2, -2,  4, 10,
 -4,  6, -6,  2,  0, -6,  0,  2, -6,  0, -6, -4, 12,
 -2, -4, -6, -2, -2, -8, -4, -4, -6, -2, -6, -4, -4, 14,
 -2,  0, -6,  0,  4, -6, -4,  0, -6,  2, -4,  0,  0, -2, 10,
 -2, -2, -6, -4,  0, -6, -4,  0, -6,  4, -4, -2,  0, -4,  2, 10,
  2,  0, -2,  0,  0, -4,  0, -2, -4,  0, -4, -2,  2, -2,  0, -2,  8,
  0, -2, -2, -2, -2, -4, -4, -4, -2, -2, -2, -2,  0, -2, -2, -2,  2, 10,
  0, -6, -2, -6, -4, -2, -6, -6,  6, -4,  2,  2, -6, -4, -4, -6, -4,  0,  8,
 -6, -8, -4, -8, -6,  2, -4, -4, -6, -6, -4, -2, -8, -8, -4, -6, -6, -4, -6, 22,
  0, -2, -4, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -4, -2, -2,  0,  0, -2, -4, -2,
 -4, -6, -4, -6, -4,  6, -6,  4, -2, -4, -2, -2, -4, -6, -2, -4, -4, -4, -2,  4, -2, 14,
 -2,  2, -6,  2,  8, -6, -4,  0, -6,  2, -6, -2,  0, -2,  6,  0,  0, -2, -4, -6, -2, -4,  8}

short blosum80mt[]
 

Initial value:

{
  7,
 -3,  6,
 -1, -6, 13,
 -3,  6, -7, 10,
 -2,  1, -7,  2,  8,
 -4, -6, -4, -6, -6, 10,
  0, -2, -6, -3, -4, -6,  9,
 -3, -1, -7, -2,  0, -2, -4, 12,
 -3, -6, -2, -7, -6, -1, -7, -6,  7,
 -1, -1, -6, -2,  1, -5, -3, -1, -5,  8,
 -3, -7, -3, -7, -6,  0, -7, -5,  2, -4,  6,
 -2, -5, -3, -6, -4,  0, -5, -4,  2, -3,  3,  9,
 -3,  5, -5,  2, -1, -6, -1,  1, -6,  0, -6, -4,  9,
 -1, -4, -6, -3, -2, -6, -5, -4, -5, -2, -5, -4, -4, 12,
 -2, -1, -5, -1,  3, -5, -4,  1, -5,  2, -4, -1,  0, -3,  9,
 -3, -2, -6, -3, -1, -5, -4,  0, -5,  3, -4, -3, -1, -3,  1,  9,
  2,  0, -2, -1, -1, -4, -1, -2, -4, -1, -4, -3,  1, -2, -1, -2,  7,
  0, -1, -2, -2, -2, -4, -3, -3, -2, -1, -3, -1,  0, -3, -1, -2,  2,  8,
 -1, -6, -2, -6, -4, -2, -6, -5,  4, -4,  1,  1, -5, -4, -4, -4, -3,  0,  7,
 -5, -8, -5, -8, -6,  0, -6, -4, -5, -6, -4, -3, -7, -7, -4, -5, -6, -5, -5, 16,
 -1, -3, -4, -3, -2, -3, -3, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -3, -2, -2, -1, -1, -2, -5, -2,
 -4, -5, -5, -6, -5,  4, -6,  3, -3, -4, -2, -3, -4, -6, -3, -4, -3, -3, -3,  3, -3, 11,
 -2,  0, -7,  1,  6, -6, -4,  0, -6,  1, -5, -3, -1, -2,  5,  0, -1, -2, -4, -5, -1, -4,  6}

short clustalvdnamt[]
 

Initial value:

{
 10,
  0,  0,
  0,  0, 10,
  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0, 10,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0, 10,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0, 10,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,
  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0,  0}

short gon120mt[]
 

Initial value:

{
  59,
   0,   0,
  -1,   0, 144,
 -18,   0, -69,  82,
  -9,   0, -68,  35,  72,
 -48,   0, -26, -87, -78, 102,
  -3,   0, -45, -14, -31, -92,  90,
 -26,   0, -31,  -7,  -6, -14, -37, 110,
 -27,   0, -36, -80, -55,  -3, -87, -48,  72,
 -19,   0, -64,  -8,  11, -67, -34,  -2, -44,  69,
 -30,   0, -39, -82, -57,  15, -82, -42,  28, -44,  66,
 -17,   0, -26, -64, -40,  11, -65, -28,  29, -27,  34,  95,
 -20,   0, -41,  26,  -1, -58,  -7,  14, -55,   5, -61, -46,  80,
  -6,   0, -68, -28, -22, -72, -41, -31, -56, -24, -44, -56, -32, 105,
 -12,   0, -56,   1,  25, -53, -30,  17, -43,  20, -30, -14,   1, -14,  74,
 -23,   0, -45, -27, -10, -68, -30,  -1, -53,  36, -44, -38, -10, -30,  16,  83,
  16,   0,  -7,  -5,  -9, -58,  -6, -14, -44, -10, -47, -29,  10,  -5,  -7, -15,  60,
   2,   0, -21, -13, -15, -47, -35, -14, -17,  -6, -34, -16,   0, -10,  -9, -16,  26,  64,
   0,   0, -11, -65, -38, -17, -65, -47,  42, -39,  13,  10, -50, -42, -36, -44, -28,  -3,  65,
 -68,   0, -29, -96, -78,  27, -66, -28, -46, -68, -29, -31, -68, -89, -49, -30, -57, -67, -59, 166,
   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,
 -48,   0, -20, -53, -56,  55, -74,  26, -31, -44, -20, -22, -28, -59, -38, -37, -35, -42, -33,  33,   0, 111,
   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0,   0}

short gon160mt[]
 

Initial value:

{
  46,
   0,   0,
   3,   0, 135,
 -11,   0, -53,  70,
  -4,   0, -52,  34,  59,
 -38,   0, -18, -70, -62,  91,
   2,   0, -34,  -7, -21, -76,  82,
 -18,   0, -23,  -1,  -1,  -7, -27,  93,
 -18,   0, -25, -62, -43,   3, -70, -37,  59,
 -12,   0, -48,  -1,  13, -53, -24,   2, -35,  55,
 -22,   0, -29, -65, -45,  19, -67, -32,  30, -34,  57,
 -12,   0, -19, -50, -31,  14, -52, -21,  29, -21,  34,  76,
 -12,   0, -31,  26,   5, -47,  -2,  15, -44,   8, -48, -36,  65,
  -1,   0, -52, -19, -14, -58, -30, -22, -43, -16, -35, -42, -22,  96,
  -7,   0, -42,   6,  23, -41, -21,  17, -32,  20, -24, -12,   5,  -8,  56,
 -16,   0, -35, -16,  -3, -53, -21,   3, -41,  35, -35, -29,  -4, -21,  17,  71,
  16,   0,  -2,   0,  -3, -45,  -1,  -8, -33,  -4, -36, -23,  11,   0,  -2,  -9,  44,
   5,   0, -14,  -6,  -8, -36, -24,  -8, -12,  -2, -24, -11,   3,  -4,  -4,  -9,  23,  50,
   1,   0,  -6, -49, -30,  -8, -52, -35,  40, -30,  17,  14, -38, -32, -27, -34, -20,   0,  53,
 -55,   0, -21, -78, -64,  32, -55, -19, -34, -54, -20, -22, -55, -74, -40, -24, -47, -54, -45, 158,
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short gon40mt[]
 

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short gon80mt[]
 

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short idmat[]
 

Initial value:

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char* nucleic_acid_order = "ABCDGHKMNRSTUVWXY"
 

short pam120mt[]
 

Initial value:

{
  3,
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 -1, -3, -3, -3, -3,  0, -4, -4,  6,
 -2,  0, -7, -1, -1, -7, -3, -2, -3,  5,
 -3, -4, -7, -5, -4,  0, -5, -3,  1, -4,  5,
 -2, -4, -6, -4, -3, -1, -4, -4,  1,  0,  3,  8,
 -1,  3, -5,  2,  1, -4,  0,  2, -2,  1, -4, -3,  4,
  1, -2, -4, -3, -2, -5, -2, -1, -3, -2, -3, -3, -2,  6,
 -1,  0, -7,  1,  2, -6, -3,  3, -3,  0, -2, -1,  0,  0,  6,
 -3, -2, -4, -3, -3, -5, -4,  1, -2,  2, -4, -1, -1, -1,  1,  6,
  1,  0,  0,  0, -1, -3,  1, -2, -2, -1, -4, -2,  1,  1, -2, -1,  3,
  1,  0, -3, -1, -2, -4, -1, -3,  0, -1, -3, -1,  0, -1, -2, -2,  2,  4,
  0, -3, -3, -3, -3, -3, -2, -3,  3, -4,  1,  1, -3, -2, -3, -3, -2,  0,  5,
 -7, -6, -8, -8, -8, -1, -8, -3, -6, -5, -3, -6, -4, -7, -6,  1, -2, -6, -8, 12,
 -1, -1, -4, -2, -1, -3, -2, -2, -1, -2, -2, -2, -1, -2, -1, -2, -1, -1, -1, -5, -2,
 -4, -3, -1, -5, -5,  4, -6, -1, -2, -5, -2, -4, -2, -6, -5, -5, -3, -3, -3, -2, -3,  8,
 -1,  2, -7,  3,  4, -6, -2,  1, -3, -1, -3, -2,  0, -1,  4, -1, -1, -2, -3, -7, -1, -5,  4}

short pam20mt[]
 

Initial value:

{
  6,
 -5,  6,
 -8,-14, 10,
 -4,  6,-16,  8,
 -3,  0,-16,  2,  8,
 -9,-12,-15,-17,-16,  9,
 -3, -4,-11, -4, -5,-10,  7,
 -8, -2, -8, -5, -6, -7,-10,  9,
 -6, -7, -7, -9, -6, -3,-13,-11,  9,
 -8, -3,-16, -6, -5,-16, -8, -8, -7,  7,
 -7,-10,-17,-15,-10, -4,-12, -7, -2, -9,  7,
 -6,-12,-16,-13, -8, -5,-10,-13, -2, -3,  0, 11,
 -5,  6,-13,  1, -3,-10, -4, -1, -6, -2, -8,-11,  8,
 -2, -8, -9, -9, -7,-11, -7, -5,-10, -8, -8, -9, -7,  8,
 -5, -4,-16, -4,  0,-15, -8,  0, -9, -4, -6, -5, -5, -4,  9,
 -8, -9, -9,-12,-11,-10,-11, -3, -6, -1,-10, -5, -7, -5, -2,  9,
 -1, -2, -4, -5, -5, -7, -3, -7, -8, -5, -9, -6, -1, -3, -6, -4,  7,
 -1, -4, -9, -6, -7,-10, -7, -8, -3, -4, -8, -5, -3, -5, -7, -8,  0,  7,
 -3, -9, -7, -9, -8, -9, -7, -7,  1,-10, -3, -2, -9, -7, -8, -9, -8, -4,  7,
-16,-11,-18,-17,-19, -6,-17, -8,-16,-14, -7,-15, -9,-16,-15, -3, -6,-15,-18, 13,
 -4, -6,-11, -7, -6, -9, -6, -6, -6, -6, -7, -6, -4, -6, -6, -7, -4, -5, -6,-13, -6,
 -9, -7, -5,-13, -9,  1,-16, -4, -7,-10, -8,-13, -5,-16,-14,-11, -8, -7, -8, -6, -9, 10,
 -4, -1,-16,  0,  6,-16, -6, -2, -7, -5, -8, -6, -4, -5,  7, -5, -6, -7, -8,-17, -6,-11,  6}

short pam350mt[]
 

Initial value:

{
  2,
  1,  3,
 -2, -5, 18,
  1,  3, -6,  4,
  1,  3, -6,  4,  4,
 -4, -5, -5, -6, -6, 13,
  2,  1, -4,  1,  1, -6,  5,
 -1,  1, -4,  1,  1, -2, -2,  7,
  0, -2, -3, -2, -2,  2, -2, -2,  5,
 -1,  1, -6,  1,  0, -6, -1,  1, -2,  5,
 -2, -4, -7, -4, -4,  3, -4, -2,  4, -3,  8,
 -1, -2, -6, -3, -2,  1, -3, -2,  3,  0,  5,  6,
  0,  2, -4,  2,  2, -4,  1,  2, -2,  1, -3, -2,  2,
  1,  0, -3,  0,  0, -5,  0,  0, -2, -1, -3, -2,  0,  6,
  0,  2, -6,  2,  3, -5, -1,  3, -2,  1, -2, -1,  1,  1,  4,
 -1,  0, -4, -1,  0, -5, -2,  2, -2,  4, -3,  0,  1,  0,  2,  7,
  1,  1,  0,  1,  0, -4,  1, -1, -1,  0, -3, -2,  1,  1,  0,  0,  1,
  1,  0, -2,  0,  0, -3,  1, -1,  0,  0, -2, -1,  1,  1,  0, -1,  1,  2,
  0, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2,  4, -2,  3,  2, -2, -1, -2, -3, -1,  0,  5,
 -7, -6,-10, -8, -8,  1, -8, -3, -6, -4, -2, -5, -5, -7, -5,  4, -3, -6, -7, 27,
  0,  0, -3, -1,  0, -2, -1,  0,  0, -1, -1,  0,  0,  0,  0, -1,  0,  0,  0, -5, -1,
 -4, -4,  1, -5, -5, 11, -6,  0,  0, -5,  0, -2, -3, -6, -5, -5, -3, -3, -2,  1, -2, 14,
  0,  2, -6,  3,  3, -6,  0,  2, -2,  1, -3, -2,  2,  0,  3,  1,  0,  0, -2, -7,  0, -5,  3}

short pam60mt[]
 

Initial value:

{
  5,
 -2,  5,
 -5, -9,  9,
 -2,  5,-10,  7,
 -1,  2,-10,  3,  7,
 -6, -8, -9,-11,-10,  8,
  0, -2, -7, -2, -2, -7,  6,
 -5,  0, -6, -2, -3, -4, -6,  8,
 -3, -4, -4, -5, -4, -1, -7, -6,  7,
 -5, -1,-10, -2, -3,-10, -5, -4, -4,  6,
 -4, -7,-11, -9, -7, -1, -8, -4,  0, -6,  6,
 -3, -6,-10, -7, -5, -2, -6, -7,  1,  0,  2, 10,
 -2,  5, -7,  2,  0, -6, -1,  1, -4,  0, -5, -6,  6,
  0, -4, -6, -5, -3, -7, -4, -2, -6, -4, -5, -6, -4,  7,
 -3, -1,-10, -1,  2, -9, -5,  2, -5, -1, -3, -2, -2, -1,  7,
 -5, -5, -6, -6, -6, -7, -7,  0, -4,  2, -6, -2, -3, -2,  0,  8,
  1,  0, -1, -2, -2, -5,  0, -4, -4, -2, -6, -4,  1,  0, -3, -2,  5,
  1, -2, -5, -3, -4, -6, -3, -5, -1, -2, -5, -2, -1, -2, -4, -4,  1,  6,
 -1, -5, -4, -6, -4, -5, -4, -5,  3, -6, -1,  0, -5, -4, -5, -5, -4, -1,  6,
-10, -8,-12,-11,-12, -3,-11, -5,-10, -8, -4, -9, -6,-10, -9,  0, -4, -9,-11, 13,
 -2, -3, -6, -3, -3, -5, -3, -3, -3, -3, -4, -3, -2, -3, -3, -4, -2, -2, -3, -8, -3,
 -6, -5, -2, -8, -7,  3,-10, -2, -4, -7, -5, -7, -3,-10, -8, -8, -5, -5, -5, -3, -5,  9,
 -2,  1,-10,  2,  5,-10, -3,  0, -4, -2, -5, -4, -1, -2,  6, -2, -3, -4, -5,-11, -3, -7,  5}

short swgapdnamt[]
 

Initial value:

{
 10,
 -9, 10,
 -9, 10, 10,
 10, 10, -9, 10,
 -9, 10, -9, 10, 10,
 10, 10, 10, 10, -9, 10,
 -9, 10, -9, 10, 10, 10, 10,
 10, 10, 10, 10, -9, 10, -9, 10,
 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10,
 10, 10, -9, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10,
 -9, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10,
 -9, 10, -9, 10, -9, 10, 10, -9, 10, -9, -9, 10,
 -9, 10, -9, 10, -9, 10, 10, -9, 10, -9, -9, 10, 10,
 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, -9, -9, 10,
 10, 10, -9, 10, -9, 10, 10, 10, 10, 10, -9, 10, 10, 10, 10,
 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10,
 -9, 10, 10, 10, -9, 10, 10, 10, 10, -9, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10}


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